Попечительский совет Московской консерватории создан в 2002 г. по инициативе Научно-аналитического отдела (в настоящее время Координационно-аналитический отдел Общевузовского центра координации творческих проектов) для оказания содействия ректору и Учёному совету в организации уставной деятельности и решении актуальных задач развития консерватории. Это первый Попечительский совет, созданный в музыкальном вузе России.

В его работе принимают участие крупнейшие государственные и коммерческие структуры, представители авторитетных российских и международных организаций. Среди персональных членов Совета — крупнейшие представители государственной администрации, бизнеса, науки и культуры. Среди них: В. Д. Ашкенази, Л. А. Бокерия, С. М. Миронов, Л. А. Михайлов, Се Ун Ли, Р. К. Щедрин и другие. Работой Совета руководит исполняющий обязанности ректора консерватории, профессор А. С. Соколов.

Работа Попечительского совета не ограничена только финансовой поддержкой консерватории. Так, одни члены Совета бесплатно предоставляют помощь консерватории по профилю своей деятельности, другие напрямую финансируют коллективы, проводят различные мероприятия в Московской консерватории. Члены Совета находятся в курсе всех основных музыкальных событий, проходящих в залах консерватории, приглашаются в качестве почётных гостей на торжественные мероприятия и концерты.

Работа с членами Совета ведётся на основе двусторонних договоров, где оговариваются все этапы взаимодействия между консерваторией и членами Совета. Организационную работу, связанную с деятельностью Попечительского совета, ведёт Координационно-аналитический отдел Общевузовского центра координации творческих проектов.